Kary za niewystawienie faktury w KSeF lub wystawienie jej poza systemem – pełne omówienie

Krajowy System e-Faktur (KSeF) to obowiązkowy system wystawiania i przechowywania faktur ustrukturyzowanych, który stopniowo obejmie wszystkich przedsiębiorców.

Niewystawienie faktury w KSeF lub jej wystawienie poza systemem (np. jako PDF czy papierową) grozi wysokimi karami pieniężnymi sięgającymi nawet 100% kwoty VAT z faktury lub 18,7% kwoty należności brutto, jeśli VAT nie jest wykazany.

Sankcje administracyjne wejdą w życie od 1 stycznia 2027 r., natomiast w 2026 r. – pierwszym roku pełnego obowiązku – kary będą zawieszone, co daje firmom czas na dostosowanie.

W tym artykule wyjaśniamy krok po kroku podstawy prawne, wysokość i terminy wprowadzenia kar oraz dodatkowe konsekwencje. Odwołujemy się do przepisów Ustawy o VAT i Kodeksu karnego skarbowego (KKS), aby księgowi i przedsiębiorcy mogli szybko zrozumieć ryzyka i przygotować się do zmian.

Obowiązek KSeF – od kiedy i dla kogo?

KSeF wprowadza obowiązek wystawiania faktur ustrukturyzowanych wyłącznie w systemie Ministerstwa Finansów. Faktura wystawiona poza KSeF (np. w programie bez integracji) jest traktowana jako niewystawiona, co blokuje jej użycie do rozliczeń VAT.

Pełny obowiązek obejmie podatników VAT etapami w 2026 r., natomiast kary pieniężne zaczną obowiązywać od 1 stycznia 2027 r. W 2026 r. brak sankcji obejmuje także błędy i opóźnienia – to okres przejściowy na wdrożenie.

Podstawę prawną stanowią zmiany w Ustawie o podatku od towarów i usług, w szczególności art. 106ni, który definiuje kary za brak wystawienia faktury ustrukturyzowanej.

Główne przypadki naruszeń i kary pieniężne

Naczelnik urzędu skarbowego nakłada kary w drodze decyzji administracyjnej. Kara musi być zapłacona w 14 dni od doręczenia decyzji na rachunek urzędu.

1. Brak wystawienia faktury ustrukturyzowanej w KSeF

Jeśli przedsiębiorca ma obowiązek, ale wystawia fakturę poza systemem (np. PDF, e-mail, papier), grozi kara do 100% kwoty podatku VAT wykazanego na fakturze. Gdy VAT nie jest wykazany – do 18,7% kwoty należności brutto (np. przy fakturach zwolnionych lub marżowych).

Przykład: faktura na 10 000 zł brutto z VAT 2 300 zł – kara do 2 300 zł (100% VAT).

Podstawa prawna: art. 106ni ust. 1 pkt 1 ustawy o VAT.

2. Nieterminowe przesłanie faktury do KSeF

Jeśli faktura została wystawiona w systemie firmy, ale nie została przesłana do KSeF w terminie (np. po awarii), obowiązują te same stawki: 100% VAT lub 18,7% kwoty brutto.

Przykład: awaria KSeF, faktura wystawiona offline, lecz nie wczytana do systemu w 5 dni – grozi kara jak wyżej.

3. Nieprzestrzeganie wzoru faktury podczas awarii systemu

W trybie awaryjnym faktura musi spełniać ściśle określony wzór. Brak zgodności skutkuje karą jak za niewystawienie faktury w KSeF.

Tabela porównawcza kar pieniężnych (nakładanych przez US)

Poniżej zestawiamy najczęstsze naruszenia i maksymalne kary, wraz z podstawą prawną:

Rodzaj naruszenia Kara przy fakturze z VAT Kara bez VAT (np. zwolnienie) Podstawa prawna
Brak wystawienia w KSeF do 100% kwoty VAT do 18,7% kwoty brutto art. 106ni Ustawy o VAT
Nieterminowe przesłanie do KSeF do 100% kwoty VAT do 18,7% kwoty brutto art. 106ni Ustawy o VAT
Nieprawidłowy wzór w trybie awaryjnym do 100% kwoty VAT do 18,7% kwoty brutto art. 106ni Ustawy o VAT

Kary z Kodeksu karnego skarbowego (KKS) – grzywny i więzienie

Oprócz kar administracyjnych z Ustawy o VAT, za niewystawienie lub wadliwe wystawienie faktury grożą sankcje karne z Kodeksu karnego skarbowego, nakładane przez sąd. Dotyczą przede wszystkim umyślnych naruszeń. Najważniejsze sankcje KKS:

  • niewystawienie faktury lub wystawienie wadliwe – grzywna do 180 stawek dziennych (art. 62 § 1 KKS);
  • wystawienie faktury nierzetelnie lub posługiwanie się taką – grzywna do 720 stawek dziennych, pozbawienie wolności (min. rok) lub obie kary łącznie (art. 62 § 2 i § 2a KKS);
  • stawka dzienna – od 1/30 minimalnego wynagrodzenia do 400-krotności (w 2026 r. min. ok. 134 zł/dzień).

Przykład: nierzetelna faktura w KSeF z zaniżonym VAT – grzywna do 720 × 134 zł = ponad 96 000 zł lub kara więzienia.

Kary z KKS stosuje się niezależnie od KSeF, ale w kontekście systemu znacząco zaostrzają ryzyka.

Dodatkowe konsekwencje braku zgodności z KSeF

Kary pieniężne to nie wszystko. Inne ryzyka to:

  • brak prawa do odliczenia VAT – faktury wystawione poza KSeF mogą być zakwestionowane, co skutkuje korektami i odsetkami;
  • problemy z JPK_V7 – brak e-faktury utrudnia lub uniemożliwia prawidłową wysyłkę plików do urzędu skarbowego;
  • kary za brak integracji oprogramowania – dokumenty z niesynchronizowanych systemów są traktowane jak poza KSeF;
  • wyższe ryzyko kontroli – urząd może uznać transakcję za nierzetelną i domagać się podatku wraz z odsetkami.

Jak uniknąć kar – praktyczne wskazówki dla księgowych

Oto praktyczne kroki, które warto wdrożyć przed wejściem sankcji:

  1. Zintegruj system fakturujący z KSeF – zrób to przed 2026 r. i przetestuj API w warunkach produkcyjnych;
  2. Przygotuj plan awaryjny – trzymaj wzory offline, określ odpowiedzialności i terminy wczytania (np. do 5 dni);
  3. Przeszkol zespół – w 2026 r. wykorzystaj okres bez sankcji na eliminację błędów strukturalnych;
  4. Monitoruj komunikaty MF – śledź aktualizacje, bo terminy i wymogi mogą ulec zmianie;
  5. Zweryfikuj status firmy – mniejsze podmioty (obrót poniżej 200 tys. zł) mogą wchodzić później, sprawdź harmonogram.

W 2026 r. wykorzystaj rok bez sankcji na pełne wdrożenie – tańsza jest integracja dziś niż zapłata 100% VAT w 2027 r.

Przestrzeganie KSeF to nie tylko unikanie kar, ale też gwarancja płynnych i przewidywalnych rozliczeń. Śledź aktualizacje Ministerstwa Finansów i konsultuj rozwiązania z doradcą podatkowym – przepisy mogą ewoluować.

Autor
Zofia Derkowska
Doświadczona księgowa, absolwentka Uniwersytetu Ekonomicznego w Poznaniu. Od ponad 10 lat wspiera przedsiębiorców w prowadzeniu księgowości, rozliczaniu podatków oraz interpretacji zawiłych przepisów. Ukończyła liczne kursy i szkolenia z zakresu rachunkowości, podatków i prawa gospodarczego. W swojej pracy stawia na praktyczne podejście i jasne wyjaśnianie nawet najbardziej skomplikowanych zagadnień. Autorka licznych artykułów edukacyjnych, poradników i analiz, które pomagają właścicielom firm odnaleźć się w świecie finansów i podatków.